Concrete applicatiecomponenten (producten)

datum: 30-04-2024 Status: IN ONTWIKKELING

Naam

Leverancier

Type

(Leveranciers) omschrijving

Atlas

OHDSI

Centrale verwerkingsomgeving

ATLAS is een gratis, openbaar beschikbare webgebaseerde, open-source softwareapplicatie ontwikkeld door de OHDSI-gemeenschap ter ondersteuning van het ontwerp en de uitvoering van observationele analyses om real-world bewijsmateriaal te genereren uit observatiegegevens op patiëntniveau.

cBioPortal

Health-RI

Centrale Verwerkingsomgeving voor genomics

Verken, visualiseer, analyseer en deel multidimensionale genomics-datasets

Galaxy

Centrale verwerkingsomgeving voor biobank data

Galaxy is een open source, webgebaseerd platform voor data-intensief biomedisch onderzoek.

Image Analysis Platform

Health-RI / BBMRI

Centrale Verwerkingsomgeving voor Images

MyDRE

anDREa

Centrale verwerkingsomgeving

Een betrouwbare oplossing voor het opslaan, verwerken en samenwerken aan gegevens

Molgenis

Molgenis

Centrale verwerkingsomgeving voor genomics

Molgenis helpt bij het vinden, vastleggen, uitwisselen, beheren en analyseren en exploiteren van de grote hoeveelheden data

Molgenis Armadillo

Molgenis

Centrale verwerkingsomgeving voor genomics

Met MOLGENIS Armadillo kunt u gegevens die in Armadillo zijn geüpload, op een federatieve manier analyseren. Dit betekent dat je de analyse naar Armadillo stuurt en de resultaten van Armadillo terug komen bij de onderzoeker.

Omero

Centrale verwerkingsomgeving voor non-DICOM beelden, met name lichtmicroscopie

Verwerkingstool voor lichtmicroscopie beelden

OpenSpecimen

Centrale verwerkingsomgeving voor biobank data

Verwerkingstool voor biobank data

Surf Compute Services

SURF

Centrale verwerkingsomgeving

XNAT

Health-RI

Centrale Verwerkingsomgeving voor Images

Uitbreidbare beeldarchieftoolkit. Archiveren, bekijken en analyseren van klinische beeldvormingsgegevens.

ICRF generator

Health-RI

Code repository

Registry in a Box (RIB)

Health-RI

Code en cookbook repository

Podium

Health-RI / BBMRI

Data access management

Een portaal om monsters, afbeeldingen en gegevens op te vragen

REMS

Data access management

Opal

Health-RI / BBMRI

Data store

Beacon

Open

Catalogus voor genomics

Gefedereerde, lokale versie

Beacon network

Open

Catalogus voor genomics

zie Beacon network voor een implementatie

Cafe variome

Catalogus

Catalogue service

Health-RI / Molgenis

Catalogus

Gebouwd op Molgenis

Covid portal

HEALTH-RI

Catalogus

Mica

HEALTH-RI

Catalogus

zie ook https://www.obiba.org/pages/products/mica/

SURF data repository

SURF

Catalogus

Vooral voor astronomische data

Nationale gezondheidsdata catalogus

HEALTH-RI

Catalogus

Zie ook https://health-ri.atlassian.net/wiki/spaces/HWV4/pages/793614308

RIVM Health and Healthcare data

RIVM

Catalogus, adressing

‘Zorggegevens’ geeft een overzicht van alle zorg- en zorgregistraties in Nederland met als doel dubbel verzamelen van gegevens te voorkomen.

FAIR data point

Catalogus, data onboarding

Img2Catalog

HEALTH-RI

Metadata extractie

Voor imaging datasets

LibreClinica

EDC Tool

Castor

EDC Tool

REDCap

EDC Tool

MPC

TNO

Federated verwerkingsomgeving

Multi party computation

Vantage6

IKNL

Federated verwerkingsomgeving

Google 2FA

Google

Identificatie services

Keycloak

Open

Identificatie services

een open source oplossing voor identiteits- en toegangsbeheer

LS AAI

ELIXIR

Identificatie services

Microsoft 2FA

Microsoft

Identificatie services

SRAM

SURF

Identificatie services

SURF Conext

SURF

Identificatie services

CBS Microdata access

CBS

Locale verwerkingsomgeving

Register, lokale verwerkingsomgeving (bij CBS)

Surf Persistent Identifiers

SURF

Localisation/adressing

Creëert persistente gegevenslocatie-ID's

CEDAR

Metadata management environment/store

Panama

Metadata store

Registratiesysteem voor onderzoeksvoorstellen

eDelivery

Platform for data exchange

Standaard voor EIDas

Surf Data archive

SURF

Storage environment

opslagomgeving voor archivering

Surf data storage and management

SURF

Storage environment

Surf Research drive

SURF

Storage environment

Cloudgebaseerde omgeving voor gedeelde opslag

Argos

Tools

ARGOS is een open uitbreidbare dienst die het beheer, de validatie, de monitoring en het onderhoud van datamanagementplannen vereenvoudigt. Het stelt actoren (onderzoekers, managers, toezichthouders enz.) in staat om bruikbare DMP's te creëren die vrijelijk kunnen worden uitgewisseld tussen infrastructuren voor het uitvoeren van specifieke aspecten van het gegevensbeheerproces in overeenstemming met de bedoelingen en inzet van gegevenseigenaren.

LDOT

Health-RI

Tools

Workflow tool voor klinisch onderzoek

Hands Toolbox

Health-RI

Tools

Tools om data FAIR te maken

HtsGet

Molgenis

Tools

API voor het veilig uitwisselen van bulk genomics gegevens

ZorgTTP

ZorgTTP

Pseudonimiseringsdienst

Mitz

VZVZ

Zeggenschapsdienst