Health-RI wiki v4.0 -> consultatie (open tot 03-12-2024)


Werkgroep Imaging

Dit artikel bevat het profiel van de werkgroep Imaging. Het profiel Imaging bevat de specifieke afspraken die gelden voor de datacategorie Imaging.

Titel

Titel

Imaging

Algemeen

Metadata van profiel

2023-08-11 Versie 0.0.1

 

Release-informatie

De scope van dit profiel betreft nu radiologie/radiotherapie (DICOM):

  • (Radiologische) beelden uit de zorg in PACS

  • Beelden en afgeleiden in onderzoeksetting in PACS, research PACS of reguliere data storage

Buiten beschouwing voor deze versie zijn: nucleaire beelden, pathologische beelden, oogheelkunde, stereolithography, videobeelden, microscopie, etc.

Organisatiebeleid

Rollen en actoren

In het artikel rollen worden de generieke rollen binnen het Health-RI ecosysteem beschreven. Binnen Imaging bestaat voor onderstaande rollen een specifieke invulling.

Databron:

  • Principal Investigator (met METC goedkeuring bij onderzoeksdata) 

  • Data verantwoordelijke: Afdelingshoofd van Research Data Management (in geval van retrospectief gebruik van zorgdata)

  • Misschien moet dit de gegevensbeheerder / onderzoeker / research assistent zijn die verantwoordelijk is voor de gegevensproductie.

Data voorbereider:

  • Hoofdonderzoeker (bijv. promovendi, postdoc, onderzoeksoftware-ingenieur)

  • Data- en domeinspecialist (o.a. Radiologen, Radiologische Fellows, technici/laboranten)

  • Gegevensbeheerder (kwaliteitscontrole, pseudonimisering, bijv. Imaging Trial Office)

  • Datamanager

Data-aanbieder:

  • Datamanager (bijv. Imaging Trial Office, datamanager Consortium, maar is niet altijd aanwezig)

  • Hoofdonderzoeker (bijv. promovendi, posdoc, research software engineer)

Lokale datatoegangscommissie kan ingevuld worden door (afhankelijk van de organisatie):

  • Medische ethische commissie: eerste goedkeuring voor dataverzameling/opzetonderzoek, alleen als in onderzoekssetting data gegenereerd wordt.

  • Functionaris gegevensbescherming

  • Dataverantwoordelijke: Afdelingshoofd van Research Data Management (Lokaal DCC, bij Amsterdam UMC).

Data-governancecommissie wordt ingevuld door

  • de Health-RI Imaging werkgroep voor imaging data nationaal

 

Applicatie / IT-infrastructuur

Manieren van gegevensuitwisseling

Er zijn verschillende leverprocessen mogelijk voor imaging data.
De opties zijn:

  1. Iemand toegang geven tot persistent data platform om te downloaden (Pull optie / centraal)

  2. Gefedereerde data node (PHT local station) toegang geven tot lokaal persistent data platform (pull optie / gefedereerd)

  3. Data zetten in DRE (of bijv centrale XNAT) (push optie / centraal)

  4. Data sturen naar gefedereerde node (push optie /gefedereerd)

  5. Data via een data-uitwisselingsplatform (bijv. WeTransfer, SURFdrive, SharePoint) naar de ontvanger sturen

Implementatie

Binnen imaging is er op de persistente datalaag een hechte koppeling tussen de imaging data en de tooling om de imaging data te bekijken en te analyseren, annoteren.

Imaging data onderzoek platforms zijn o.a.:

  • lokale XNAT (alleen DICOM)

  • staging area van grand-challenge (AWS)

  • lokale Flywheel (commerciele versie van XNAT)

  • Conquest

  • Orthanc

  • netwerkschijf met bepaalde structuur icm data manager en set scripts/guidelines om die structuur te forceren

  • elk ander "research-PACS systeem

  • Hyland VNA (Vendor Neutral Archive)

  • Philips systeem (e/MTIC)

  • Microsoft Azure Datalake

  • Google Health api

  • AWS Health lake

Zie ook Verhaallijn: Imaging data beschikbaar maken

Pseudonimisatie

Bij het overzetten naar de persistente datalaag worden de DICOM bestanden gepseudonimiseerd: direct identificeerbare velden uit de DICOM header zijn verwijderd en vervangen door een ander ID.

 

Â